Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phtf2Q8CB19 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phtf2Q8CB19 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phtf2Q8CB19 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms