Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nhsl1Q8CAF4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nhsl1Q8CAF4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nhsl1Q8CAF4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nhsl1Q8CAF4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nhsl1Q8CAF4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nhsl1Q8CAF4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nhsl1Q8CAF4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nhsl1Q8CAF4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms