Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg4aQ8C9S8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg4aQ8C9S8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg4aQ8C9S8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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