Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spef2Q8C9J3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spef2Q8C9J3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spef2Q8C9J3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Spef2Q8C9J3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms