Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dclre1bQ8C7W7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dclre1bQ8C7W7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms