Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7cQ8C6E1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Apol7cQ8C6E1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms