Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Bhlhe22Q8C6A8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms