Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sfrp1Q8C4U3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sfrp1Q8C4U3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sfrp1Q8C4U3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms