Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsfm13Q8BXS2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsfm13Q8BXS2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms