Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt3Q8BXF8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Actrt3Q8BXF8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt3Q8BXF8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms