Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skor1Q8BX46 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Skor1Q8BX46 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Skor1Q8BX46 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms