Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctdsp2Q8BX07 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ctdsp2Q8BX07 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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