Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp38Q8BW70 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp38Q8BW70 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp38Q8BW70 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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