Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep55Q8BT07 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep55Q8BT07 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep55Q8BT07 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms