Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQC3

Igdcc3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc3Q8BQC3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Igdcc3Q8BQC3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Igdcc3Q8BQC3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms