Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AtripQ8BMG1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AtripQ8BMG1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AtripQ8BMG1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms