Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Usp54Q8BL06 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp54Q8BL06 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp54Q8BL06 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp54Q8BL06 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms