Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PolrmtQ8BKF1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PolrmtQ8BKF1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms