Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabra5Q8BHJ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gabra5Q8BHJ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gabra5Q8BHJ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms