Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GopcQ8BH60 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GopcQ8BH60 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GopcQ8BH60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms