Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SynprQ8BGN8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SynprQ8BGN8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms