Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Samm50Q8BGH2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Samm50Q8BGH2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Samm50Q8BGH2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms