Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms