Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pknox2Q8BG99 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pknox2Q8BG99 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pknox2Q8BG99 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms