Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Srgap3Q812A2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Srgap3Q812A2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms