Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smim19Q80ZU4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim19Q80ZU4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Smim19Q80ZU4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smim19Q80ZU4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms