Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otop3Q80UF9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otop3Q80UF9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otop3Q80UF9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otop3Q80UF9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms