Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ube3cQ80U95 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ube3cQ80U95 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ube3cQ80U95 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms