Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
NischQ80TM9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
NischQ80TM9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC43.53■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
NischQ80TM9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC43.49■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC43.46■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
NischQ80TM9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
NischQ80TM9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
NischQ80TM9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms