Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lamp3Q7TST5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lamp3Q7TST5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms