Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ube2q1Q7TSS2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube2q1Q7TSS2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube2q1Q7TSS2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms