Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnkQ7TSL0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms