Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdp1Q7TSG2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdp1Q7TSG2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms