Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfsf18Q7TS55 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf18Q7TS55 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms