Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rpf1Q7TND5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpf1Q7TND5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpf1Q7TND5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms