Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcl2Q78Y63 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcl2Q78Y63 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdcl2Q78Y63 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms