Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssh1Q76I79 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssh1Q76I79 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms