Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spcs3Q6ZWQ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spcs3Q6ZWQ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms