Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Syne2Q6ZWQ0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Syne2Q6ZWQ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms