Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Topbp1Q6ZQF0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Topbp1Q6ZQF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Topbp1Q6ZQF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Topbp1Q6ZQF0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms