Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp34Q6ZQ93 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp34Q6ZQ93 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp34Q6ZQ93 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms