Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casc1Q6TDU8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc1Q6TDU8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc1Q6TDU8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms