Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npc1l1Q6T3U4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Npc1l1Q6T3U4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Npc1l1Q6T3U4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms