Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300lfQ6SJQ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cd300lfQ6SJQ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300lfQ6SJQ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms