Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bnip1Q6QD59 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bnip1Q6QD59 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bnip1Q6QD59 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms