Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q899

Ddx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, mousemouse

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx58Q6Q899 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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Ddx58Q6Q899 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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Ddx58Q6Q899 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx58Q6Q899 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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Ddx58Q6Q899 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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Ddx58Q6Q899 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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Ddx58Q6Q899 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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Ddx58Q6Q899 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Ddx58Q6Q899 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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Ddx58Q6Q899 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
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Ddx58Q6Q899 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ddx58Q6Q899 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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Ddx58Q6Q899 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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Ddx58Q6Q899 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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Ddx58Q6Q899 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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Ddx58Q6Q899 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx58Q6Q899 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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Ddx58Q6Q899 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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Ddx58Q6Q899 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx58Q6Q899 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx58Q6Q899 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx58Q6Q899 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx58Q6Q899 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ddx58Q6Q899 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx58Q6Q899 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ddx58Q6Q899 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
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Ddx58Q6Q899 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ddx58Q6Q899 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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