Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CtifQ6PEE2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CtifQ6PEE2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CtifQ6PEE2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms