Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vstm2lQ6PDS0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vstm2lQ6PDS0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms