Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc36Q6PDM4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc36Q6PDM4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms