Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W5

Tsen2, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen2Q6P7W5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsen2Q6P7W5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsen2Q6P7W5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsen2Q6P7W5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsen2Q6P7W5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsen2Q6P7W5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsen2Q6P7W5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsen2Q6P7W5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsen2Q6P7W5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tsen2Q6P7W5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tsen2Q6P7W5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tsen2Q6P7W5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsen2Q6P7W5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsen2Q6P7W5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsen2Q6P7W5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tsen2Q6P7W5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsen2Q6P7W5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsen2Q6P7W5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tsen2Q6P7W5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms